Sintesis inti polisakarida dimulai dari lipid Ⅳ a. Setelah menambahkan KDO (core oligosaccharide) pada posisi C-6' glucosamine non-reducing, heptosa, dan hexose ditambahkan secara bertahap

1. Sintesis dan adhesi KDO

Sintesis KDO mencakup tiga reaksi berkelanjutan: ① 5-fosfat D-ribosa ↔ 5-Phospho-D-arabinose. ② 5-fosfat - D-arabinosa fosfoenolpiruvat → 8-fosfat - KDO fosfat. ③ 8-fosfat - asam alkanoat KDO. Ketiga reaksi ini dilakukan di bawah katalisis isomerase 5-fosfo-D-nukleat, sintetase 8-fosfor-KDO, dan 8-fosfatase. Gen anak yang terletak pada 27 menit kromosom mengkode sintetase 8-fosfor-KDO.

KDO menghasilkan bentuk aktif CMP-KDO di bawah katalisis sintetase CMP-KDO. Enzim yang mengkatalisis reaksi ini dikodekan oleh gen kds B yang terletak pada 85 menit kromosom. CMP-KDO mengikat KDO ke C-6 'lipid Ⅳ a di bawah katalisis protein fungsi ganda atau tri-fungsi WaaA, dan kemudian menambahkan molekul KDO kedua ke molekul KDO pertama.

2. Sintesis daerah heptosa dan heksosa

Heptosa ditambahkan ke polisakarida inti satu per satu dalam bentuk aktivasi ADP dan heksosa dalam bentuk aktivasi UDP. Glikosiltransferase yang mengkatalisasi monosakarida nukleotida termasuk dalam serangkaian glikosiltransferase yang berhubungan dengan membran, yang mentransfer gugus gula ke molekul lipid A yang matang pada permukaan sitoplasma membran sel. Molekul inti lipid A yang disintesis dapat ditransfer dari permukaan sitoplasma membran sel ke permukaan periplasma membran sel dengan partisipasi perangkat transpor ABC [transporter kaset pengikat ATP (ABC)], dan menyelesaikan reaksi koneksi dengan rantai polisakarida antigen O pada permukaan periplasma untuk menghasilkan molekul LPS yang lengkap. Selain itu, inti lipid A juga dapat digunakan sebagai reseptor enterobacterial common antigen (ECA) dan rantai polisakarida antigen kapsul K dari kelompok Escherichia coli.

Glikosiltransferase atau enzim pengubah yang terlibat dalam sintesis polisakarida inti dikodekan oleh kelas gen yang disebut wa ※ ※, yang terletak pada 81-82 menit kromosom, antara gen cysE dan pyrE, dan gen ini didistribusikan dalam tiga operon . Untuk lima struktur inti Escherichia coli, komposisi gen dan distribusi genetik dari sintesis inti yang berbeda berbeda.

Operon waaA mengandung gen struktural waaA yang mengkode transferase KDO bifungsional atau trifungsional dan gen polipeptida dengan fungsi yang tidak diketahui dan berat molekul relatif 18000. Produk gen gmhD, waaF, dan waaC dalam operon gmhD terkait dengan sintesis dari daerah inti heptosa, sedangkan operon waaQ terkait dengan sintesis daerah heksosa luar dan modifikasi kimia dari daerah inti. Dalam Escherichia coli K-12, transkripsi operon gmhD diatur oleh promotor kejut panas dan transkripsi operon apa yang diatur secara positif oleh daerah yang tidak diterjemahkan di bagian atas operon dan faktor pemanjangan transkripsi RfaH.