LBP (protein pengikat lipopolisakarida) adalah glikoprotein dengan berat molekul relatif 60000. Struktur proteinnya adalah polipeptida rantai tunggal dengan berat molekul relatif 5000. Ia mengalami reaksi glikosilasi dalam badan Golgi dan disekresikan ke dalam darah setelah kematangan menjadi glikoprotein. LBP tidak tahan panas, dan aktivitasnya biasanya stabil pada 50 ℃, dan sekitar 50% aktivitasnya hilang antara 53 dan 56 ℃. Ketika serum tikus atau LBP murni tikus dipanaskan hingga 59 ℃, aktivitasnya benar-benar hilang. Plasma manusia sensitif terhadap panas. Metode inaktivasi komplemen yang paling umum (56 ℃, 30 menit) dapat menyebabkan 70% hilangnya aktivitas biologis LBP.

Saat ini, telah diklarifikasi bahwa urutan asam amino dari protein LBP manusia adalah rantai polipeptida protein dewasa yang terdiri dari peptida urutan sinyal dengan 25 residu asam amino dan 452 residu asam amino. Ada empat sistein dan lima situs pengikatan glikosilasi pada rantai polipeptida, yang masing-masing terletak di situs 275~277, 325~327, 330~332361~363, dan 369~371 dari rantai polipeptida. Struktur protein LBP kelinci sangat mirip dengan manusia. Ini juga terdiri dari rantai polipeptida hidrofobik yang terdiri dari 26 residu asam amino dan rantai polipeptida protein yang terdiri dari 456 residu asam amino. Urutan asam aminonya sangat homolog dengan manusia, dengan 69% urutan asam amino yang sama; Urutan nukleotida adalah 78% konsisten, tetapi hanya berisi 2 situs pengikatan sistein dan 3 glikosilasi, yang masing-masing terletak di situs 275~277, 325~327, dan 361~363. Konformasi spasial kimia LBP masih belum jelas, yang mungkin mirip dengan BPI (protein peningkat bakterisida/permeabilitas).