Lipid bakteri usus khas A adalah 1,4-difosfat- β 1,6 yang terhubung dengan glikosaminodisakarida sebagai tulang punggung, dan menghubungkan asam lemak 3-hidroksi atau residu 3-asil karboksil dengan ikatan amida dan ester. Struktur ini tidak umum untuk semua bakteri gram negatif. Secara khusus, struktur di atas jarang ditemui pada famili yang jauh dari bakteri koliform, seperti Bradyrhizobia.

Pada awalnya, struktur lipid A yang diturunkan dianggap sebagai tipe lipid A yang "tidak normal", dan sekarang diganti namanya menjadi varian lipid A. Misalnya, Thiobacillus, Rhizobiaceae, Nitrobacter, Brucella, Chromatim Party, Chlorobium N ad son, dll. Ada perubahan nyata pada struktur kerangka LPS, dan pada substitusinya. Varian lipid A memiliki bentuk tipe transisi (atau diubah), pada Rhodobacter sphaeroides, hanya sebagian dari asam lemak 3-hidroksi yang berikatan dengan amida yang digantikan oleh asam 3-oksimiristik. Sebagai lipid, polisakarida kerangka, glikosamin bakteri berpigmen selalu disertai dengan sejumlah kecil koneksi 2,3-diamino-2,3-dideoksi-D-glukosa (DAG).

DAG hanya ada dalam gula kerangka lipid A. Turunan asam uronat dari 2,3-diamine-2,3-dideoxhexose telah dilaporkan sebagai antigen bakteri (rantai O) dari berbagai serotipe Pseudomonas aeruginosa.

3- asam oksimiristik: Kehadiran asam 3-oksimiristik pertama kali dilaporkan pada bakteri Listenella anguillarum dan eritroid. Sekarang, sebenarnya, semua spesies dan galur bakteri gram negatif cabang α-3 dapat diamati.

Endotoksin dengan efek biologis paling signifikan adalah LPS heterogen, yang sering digunakan sebagai standar untuk menguji reaksi sel dan melakukan penelitian tentang efek terapeutik. Bagian aktivitas biologisnya dari lipid A terdiri dari β-1,6 yang terdiri dari D-glukosamin disakarida dan enam asam lemak jenuh dan dua radikal fosfat bermuatan negatif. Perubahan susunan struktur tersebut, seperti berkurangnya jumlah muatan, berkurangnya gugus asil lemak, berubahnya distribusi rantai asil lemak, dan derajat kejenuhan asil lemak dapat menyebabkan penurunan sifat biologisnya. kegiatan. Ini menunjukkan bahwa perubahan struktur primer endotoksin pasti akan mempengaruhi aksi fisikokimianya. Seydel et al. menegaskan bahwa stereostruktur LPS dalam endotoksin terkait erat dengan efek biologisnya. Struktur tiga dimensi yang berbeda dapat menghasilkan efek yang berbeda. Secara umum, struktur spasial kerucut sering mengarah pada efek aktivasi sel, sedangkan struktur spasial silinder LPS sering merupakan antagonis endotoksin untuk menghambat aktivasi sel.