Setelah polimer antigen O terhubung dengan inti lipid A, itu akan menghentikan reaksi polimerisasi. Artinya, reaksi koneksi dapat menghentikan reaksi polimerisasi. Inti dari lipid A dan lipopolisakarida dengan unit pengulangan panjang yang berbeda dapat ditransfer secara efektif ke membran luar. Oleh karena itu, ukuran molekul lipopolisakarida dapat dilihat dengan SDS-PAGE, yang disebabkan oleh perbedaan sistem biosintesis daripada faktor sistem keluaran.

Distribusi rantai samping antigen O pada bakteri yang berbeda berbeda, beberapa di antaranya mengandung sekitar 20 unit berulang dan beberapa di antaranya mungkin sekitar 100 unit berulang. Dalam elektroforesis SDS-PAGE, perbedaan intensitas pewarnaan perak dari molekul yang berbeda dari spesies bakteri yang berbeda tercermin. Alasan untuk distribusi yang berbeda dari panjang rantai samping antigen O pada bakteri yang berbeda mungkin karena ada faktor pemilihan ukuran dalam proses polikondensasi antigen O atau reaksi koneksi. Wzz (yaitu Rol atau Cld) adalah protein penting yang mengatur distribusi panjang rantai samping pada bakteri yang mensintesis antigen melalui jalur yang bergantung pada Wzy, tetapi mekanisme spesifiknya masih belum jelas.