Komposisi endotoksin yang berbeda dapat menyebabkan tiga bentuk fenotipe bakteri, yaitu tipe halus, tipe kasar, dan tipe menengah (disebut juga tipe mukus). Ketika komponen inti polisakarida berkurang atau rusak, penampakan koloni kultur bakteri kasar, sehingga disebut mutan kasar (rough-LPS, R), yang dapat disebut Rb-LPS, Rc-LPS, Rd-LPS, Re -LPS sesuai dengan tingkat cacat polisakarida inti, seperti yang ditunjukkan pada gambar .

Mikroskop elektron LPS Escherichia coli dengan koloni halus adalah struktur seperti tali yang ramping, sedangkan LPS Escherichia coli tipe kasar sebagian besar adalah struktur melingkar. Karena panjang rantai gula yang berbeda, efek hambatan sterik yang berbeda akan dihasilkan, yang akan mempengaruhi pengenalan dan fagositosis LPS dan CNB oleh sel-sel kekebalan tubuh, sehingga inang akan memiliki efek kekebalan yang berbeda terhadapnya dan mempengaruhi pembersihan bakteri oleh tubuh.

Rantai gula tipe kasar pendek dan mudah ditelan oleh fagosit, seperti fagosit kerja: neutrofil, dan makrofag, yang mudah untuk menghilangkan bakteri tipe kasar; Rantai gula halus panjang, memiliki halangan sterik, tidak mudah ditelan oleh fagosit dan digabungkan dengan komplemen, dan mudah lepas dari respon imun tubuh terhadapnya.